重磅 | 最新中国CNS指数出炉,中国科学院排名第一
The following article is from iNature Author iNature
9月10日
ON SEPTEMBER 10
教师节
教师节快乐!截止2018年9月4日,中国学者总共在Cell,Science及Nature杂志发表了68篇生物科学相关的文章(2018年),已经赶超了去年的总数,涌现了一大批优秀的成果,如克隆猴,酵母单个染色体,剪切复合体成果等。
iNature联合100位PI/教授推出中国CNS生物科学指数(CCBSI)。众专家及iNature团队一致同意,暂时确定的规则如下(同时也欢迎大家留言讨论):
【1】所有的文章是Article/Letter/Report研究型文章,不包括综述;
【2】Cell,Natue及Science单篇文章的权重设为10;
【3】如果通讯作者挂了多个单位,只看排名最靠前的1个单位;
【4】如果通讯作者只有一个,那么该第一单位得分是10分;
【5】如果通讯作者存在多个,那么第一通讯作者单位按其他非第一通讯作者单位的2倍计算(比如有2个通讯作者,那么第一通讯单位得分6.7,非第一通讯作者单位得分3.3;如果有3个通讯作者,则第一通讯单位得分5,其他2个非第一通讯单位各得分2.5;之后以此类推);
【6】如果通讯作者单位与第一单位不一样(经过估计,这大约会出现1-2%的概率),那么第一单位记为2倍积分;
【7】通讯作者越多,第一通讯单位得分越低。
来源:iNature
选稿:Brainnews| Simon
题图:网络
排版:Brainnews| Ya
1.总体情况
经过系统分析,我们发现,对于这68篇文章总共有35个中国的通讯单位(中国科学院合并成一个单位),其中中国科学院得分最高,到达了168.9,之后就是清华大学,北京大学,浙江大学,复旦大学,具体排名如下(图1所示):
图1.总体排名情况
2.合作情况
对于这68篇文章,我们发现有37篇文章只有1个通讯机构,这很大部分都集中在结构领域;而剩下的31篇文章主要是多机构合作完成。
3.中科院
由于中科院机构众多,我们就把中科院进行细分,我们发现,生物物理所排名第一,之后就是上海生科院,遗传发育所,上海药物所等(图2所示)。
图2.中科院排名情况
4.典型文章解析
【1】3000多份水稻测序,推动中国水稻领域跨越式发展
2018年4月26 日,国际顶级期刊《自然》杂志长文发表由中国农业科学院作物科学研究所牵头,联合国际水稻研究所、上海交通大学、华大基因、深圳农业基因组研究所、安徽农业大学、美国亚利桑那大学等16家单位共同完成的“3010份亚洲栽培稻基因组研究”。
该研究针对水稻起源、分类和驯化规律进行了深入探讨,揭示了亚洲栽培稻的起源和群体基因组变异结构,剖析了水稻核心种质资源的基因组遗传多样性。这一重大成果将推动水稻规模化基因发掘和水稻复杂性状分子改良,提升全球水稻基因组研究和分子育种水平,加快优质、广适、绿色、高产水稻新品种培育。
该研究是国内外水稻研究专家大协作的重大成果,体现了中国农业科学在水稻基因组研究方面居于世界领先位置,并扩大了我国水稻功能基因组研究国际领先优势。在扩大开放的大背景下,重大数据共享和重大项目合作,为我国乃至全球农业研究水平带来更大的飞跃。
原文链接:
https://doi.org/10.1038/s41586-018-0063-9
【2】克隆猴的诞生
中国科学院神经科学研究所孙强团队24日下午在北京宣布,团队经过5年的不懈努力,突破了体细胞克隆猴的世界难题,成功培育出世界首个体细胞克隆猴。这标志着中国将率先开启以猕猴作为实验动物模型的时代。
2017年11月27日世界上首个体细胞克隆猴“中中”在中科院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心的非人灵长类平台诞生;12月5日第二个克隆猴“华华”诞生。两只克隆猴均为雌性。在科研人员精心呵护下,截至目前,两只小猴子的各项身体指标均很正常,发育状态良好。
【3】组蛋白去甲基化酶KDM6B调节海龟物种的温度依赖性性别决定
爬行动物中的性别决定是一个复杂的事情,因为孵化温度和基因在许多物种中相互作用以调节性发育并决定性命运,雄性或雌性。一个尚未解决的中心问题是,什么样的分子机制可以使温度如此深远地影响决定性别的发育途径?
在具有遗传性别决定的物种中鉴定一个主要决定性别基因的手段已经很成熟 - 在性染色体上鉴定基因,证明哪些在发育早期在雄性和雌性胚胎中差异表达,并操纵它们的表达以证明逆转性别。
鉴别温度依赖性性别决定(TSD)的机制并非如此。温度可以影响许多涉及性分化的常染色体基因,即使那些外周参与的基因,只要它们的改变的表达能够逆转性别即可。难怪在TSD在爬行动物中被发现后的50年里,我们对TSD机制的理解还没有进展。
葛楚天等研究组显示在26°C(所有后代发育成雄性的温度)下Kdm6b的敲除触发了80%以上存活胚胎中的雄性对雌性的性逆转。 KDM6B通过消除H3K27在其启动子附近的三甲基化直接促进雄性决定基因Dmrt1的转录。
另外,Dmrt1的过表达足以拯救Kdm6b破坏引起的性反转。本研究建立了龟类物种表观遗传机制与温度依赖性别决定之间的因果关系和直接遗传联系。
5.文章列表
(其中红色加粗的为第一通讯单位,按时间依次排序,图3所示)
图3.文章列表
如果有遗漏或者是错误,欢迎大家在留言区进行讨论。
前 文 阅 读
2,前沿 | 新机制!Tau蛋白如何损害阿兹海默病患者的脑细胞?.
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